Yayasan Badan Wakaf Ma’had Islam Pekalongan beraqidah Ahlus Sunnah wal Jama’ah dengan bermadzab Asy-Syafi’i dengan menghormati Madzab Hanafi, Madzab Maliki dan Madzab Hambali
Logo Ma'had Islam Pekalongan
Motif Batik diatas merupakan karya dari Abdul Aziz Muslim, pemenang lomba desain batik Ma’had Islam yang memiliki filosofi:
Bingkai Segi Empat menggambarkan Dakwah Ma’had Islam bersandar pada Imam Syafi’i tapi tetap bertoleransi kepada Imam Madzab lainnya.
Gambar Bunga berkelompok lima ditengah menggambarkan Rukun Islam
Berkelopak Enam diluar, menggambarkan rukun iman
Berdaun sembilan, menggambarkan kearifan lokal Wali Songo
Mikhrob ditengah ada mata pena dan Kitab Al-Qur’an dibawahnya:
Dakwah menitikberatkan pada Pendidikan Islam dan Al-Qur’an sebagai pedoman utama
Sayap Garuda, melambangkan cita-cita luhur dakwah Ma’had Islam bisa merambah keseluruh Negeri
Artinya :
Ya Allah, aku berlindung kepada Mu dari bisikan syetan dan aku berlindung kepada Mu ya Allah akan kehadiran mereka. Ya Allah, aku pada pagi hari ini bersaksi kepada Mu, kepada yang mengangkat Arsy Mu, kepada malaikat Mu dan seluruh makhluk Mu, bahwa Engkau adalah Allah, tiada Tuhan selain Engkau, Maha Esa Engkau, tiada sekutu bagi Mu dan sesungguhnya Muhammad adalah Hamba Mu dan Utusan Mu.
Pada pagi hari ini kita dalam Fitrah Islam dengan kalimat Ikhlas dan di atas Agama Nabi Muhammad SAW. Kita pada jalan Bapak kita Ibrahim secara lurus dan tunduk dan tidaklah tergolong dari pada orang–orang musyrikin.
Ya Allah, dengan Engkau kami pada pagi hari dan dengan Engkau pula kami pada sore hari, dan dengan Engkau kami hidup serta dengan Engkau kami mati dan kepada Mu semua kembali. Pagi hari ini kami semua dan seluruh kerajaan adalah bagi Allah Tuhan seluruh alam.Ya Allah, apa yang pada hari ini kami terima dari nikmat atau bagi seseorang dari makhluk Mu hanya dari Engkau sajalah, tidak ada sekutu bagi Mu, maka bagi Mu segala Puji dan Syukur atas yang demikian itu.